Sejak tahun 2008 penyelenggaraan pendidikan Program Studi S2 Akuntansi didirikan di bawah Fakultas. Ekonomi dan Bisnis Universitas Batam. Secara resmi, program studi tersebut berdiri pada tahun 2008, melalui Surat Keputusan Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi Nomor 2053/D/T/2008 Tertanggal 3 Juli 2008 tentang Ijin Penyelenggaraan Program Studi Akuntansi Jenjang S2. Sebagai program studi yang didasarkan pada prinsip akuntansi yang kuat, kami berkomitmen untuk menyediakan kurikulum yang relevan dan terkini, serta lingkungan akademik yang mendukung pengembangan profesional dan intelektual. Kami percaya bahwa lulusan Program Studi S2 Akuntansi dari Universitas Batam akan memiliki kompetensi yang sangat dibutuhkan oleh berbagai sektor. Didukung oleh para tenaga pengajar yang kompeten di bidang Akuntansi, Program Studi S2 Akuntansi menyediakan kurikulum yang relevan, terkini, serta spesifik namun tetap fleksibel agar dapat mengakomodasi kebutuhan lulusan dalam upaya untuk memiliki kompetensi tersebut, yang mendukung perkembangan pengetahuan dan teknologi serta kebutuhan dunia kerja di bidang bisnis agar dapat bersaing di dunia global.

1. Menyelenggarakan proses pembelajaran yang aplikatif dan berkualitas dengan memanfaatkan perkembangan teknologi informasi ke-Akuntansi-an.

2. Menyelenggarakan penelitian yang memberikan kontribusi terhadap masyarakat dan pengembangan ilmu Akuntansi.

3. Menyelenggarakan pengabdian masyarakat melalui pemberdayaan sumber daya manusia serta meningkatkan nilai tambah bagi masyarakat.

4. Memberikan peningkatan kemampuan pada Dosen dan Tenaga Kependidikan.

1. Meningkatkan kemampuan dan daya saing lulusan S2 Akuntansi di bidang ilmu akuntansi.

2. Menghasilkan lulusan yang memiliki kompetensi di bidang ilmu akuntansi.

3. Menghasilkan penelitian yang memberikan kontribusi terhadap masyarakat dan perkembangan ilmu akuntansi khususnya dalam bidang akuntansi keuangan, manajemen akuntansi dan akuntan publik.

4. Meningkatkan peran lulusan dalam pengembangan ilmu akuntan publik dan menciptakan nilai tambah bagi masyarakat.

Lulusan Program Studi S2 Akuntansi diharapkan dapat menjadi akuntan di berbagai sektor baik publik maupun privat , manajer akuntansi perusahaan, konsultan, peneliti serta pendidik di bidang akuntansi yang memiliki kesadaran etis, berjiwa bisnis entrepreneur serta pola pikir yang holistik. Di samping itu lulusan Program Studi S2 Akuntansi juga diarahkan untuk mempunyai cara berpikir yang mendalam dalam memahami isu-isu akuntansi kontemporer secara global baik secara teoritis maupun empiris.